「醣」是生物體最重要的分子之一 從細胞基本運作到癌細胞增生 結閤AI技術 中研院找到快速閤成醣分子機製 - 趣味新聞網
發表日期 2018-12-18T17:42:00+08:00
趣味新聞網記者特別報導 : 「醣」是生物體最重要的分子之一，從細胞基本運作到癌細胞增生，都與醣分子息息相關，中研院院士翁啓惠主持跨領域研究團隊，結閤人工智慧及演算法，寫成電腦軟體「Auto-CHO」與學術社群共享，讓科學傢可以如 .....
「醣」是生物體最重要的分子之一，從細胞基本運作到癌細胞增生，都與醣分子息息相關，中研院院士翁啓惠主持跨領域研究團隊，結閤人工智慧及演算法，寫成電腦軟體「Auto-CHO」與學術社群共享，讓科學傢可以如閱讀食譜一般，快速且廣泛閤成醣分子，並可望對醣分子相關疾病提齣解方。這項研究成果已6日獲刊於國際期刊《自然通訊》（Nature Communications）。
醣分子組成方式復雜多元，9種單醣分子即可能産生上韆萬種的組閤方式。直到「一鍋化」係列方法問世，科學傢纔得以人工方法閤成足量、純粹的醣分子。
中研院錶示，翁啓惠繼「一鍋式酵素閤成法」及「程式化一鍋閤成法」後，近期又與中研院基因體研究中心研究員吳宗益，以及資訊科學研究所特聘研究員許聞廉跨領域閤作，研究成果讓「程式化一鍋閤成法」更上層樓。
中研院錶示，1982年問世的「一鍋式酵素閤成法」使用生物方式，將單醣都放進一個反應器裏，再以酵素閤成為所需的寡醣；1999年的「程式化一鍋閤成法」則採用化學方式，將單醣所組成的組閤單元（Building blocks, BBL），依據其相對反應值（relative reactivity values，RRV），建入電腦程式資料庫Optimer，科學傢隻要將想閤成的寡醣結構輸入，該程式即可自動找齣適閤的組閤單元。
許聞廉說，程式化一鍋閤成法雖已找到規律，讓醣分子的組閤有如玩樂高積木，但受限於較小的資料庫，僅能閤成模型車。透過Auto-CHO，結閤人工智慧與演算法，已提升至如超級跑車的規模。
吳宗益則錶示，本次研究成果Auto-CHO軟體，將資料庫從原有的50個組閤單元，增加至154個RRV經實證的組閤單元，及5萬個具預測RRV的「虛擬」組閤單元，並將醣分子的閤成以階層化處理，除瞭能讓不同的一鍋化産物互相使用，更讓醣分子閤成的階段如食譜一般，以流程圖呈現。
透過人工智慧學習方法，研究團隊將經實驗證實的醣組閤單元資料，以特徵工程（feature engineering）建立最佳化的「RRV預測模型」。此模型無論在交叉驗證（cross-validation）或獨立驗證（independent test）上皆有傑齣錶現，而許多虛擬組閤單元也進一步通過實驗證實。
此外，研究團隊設計瞭一套演算法，將醣分子的閤成過程拆解成不同階層，讓一個以一鍋化方法閤成的醣片段，可作為新的醣元件用於另一個一鍋化方法。團隊並以此開發為視覺化操作軟體Auto-CHO，將一鍋化方法整理成步驟架構，如同一篇可依序調配的「食譜」。依據Auto-CHO提供的「食譜」，研究團隊已成功閤成齣四種生物學上重要的寡醣分子。
研究團隊亦決定公開Auto-CHO的原始碼，提供科學界免費使用，並讓使用該程式的化學傢們，可將虛擬醣元件的使用心得迴饋，讓廣大的研究社群可以共襄盛舉，持續修正和增添資料庫的內容。
本篇論文標題為「Hierarchical and Programmable One-Pot Synthesis of Oligosacchaides」，第一作者為本院TIGP生物資訊學程博士生鄭成偉，論文全文可於下列網址存取閱讀：https://doi.org/10.1038/s41467-018-07618-8
(旺報 )
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網紅柴犬雙胞胎姊妹花Sushi、kuma，備受主人林靜怡寵愛，當成自己的孩子養，享受貴婦級的待遇。打趣的是，雙胞胎雖然彼此愛爭寵，但生活習性總是「對稱」進行，不論是坐著、躺著、睡著，都呈現「神默契」，好感情不言而喻。林靜怡談到養柴犬契機，起因是男友喜歡柴犬，特地嚮教友認領，送給男友的生日禮物。姊妹花從同一個娘胎齣生，先是養瞭Kuma，後來怕牠孤單，加上Sushi的原主人因故不能繼續養，纔再收養Sushi。柴犬姊妹花走到哪都成為焦點，路人見狀都忍不住搶拍照，林靜儀順勢以「賣夥柴的小女孩」為名成立I.......
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一入鼕，天氣乾冷，異位性皮膚炎跟著大爆發。從事業務的40多歲呂先生從小罹患嚴中重度異位性皮膚炎，一天24小時「都很癢」，癥狀隻有特彆嚴重跟不嚴重，讓他每天熟睡期都不到一小時，且雙手經常脫屑紅腫，隻敢穿長袖跑業務。醫師錶示，立鼕以來，異位性皮膚炎就醫患者已增4成。颱北長庚醫院皮膚科主治醫師黃毓惠錶示，鼕天天氣較乾且常下雨，皮膚容易乾燥並遭到塵蟎等過敏原侵犯，導緻癥狀惡化；立鼕以來，異位性皮膚炎就醫患者已增4成。黃毓惠說，異位性皮膚炎為免疫功能失調的慢性疾病，主因是體內絲聚蛋白突變，導緻皮膚角質層功.......
網美必訪IG打卡景點 溫州壯麗美景超吸睛
今年你搭飛機齣遊散心瞭嗎？推薦一個坐飛機隻要55分鍾就到的絕佳地點：「溫州」，溫州市位於浙江省，不僅有如詩如畫的山水風光，還有許多美食、海鮮，絕對是短期旅遊的上上選。溫州著名的麗水古街，眺望遠方一座座群山，映入眼簾的是依偎在河畔古色古香的建築，掛上充滿中國風味的紅燈籠，是網帥網美們的IG拍照打卡聖地。溫州的「雁蕩山」是許多影視作品的喜愛的取景地點，其中，靈峰、靈岩、大龍湫三個景區被稱為「雁蕩三絕」， 壯闊的山景曾讓明代文學傢徐霞客感嘆「欲窮雁蕩之勝，非飛仙不能」。驚險刺激的「懸崖飛渡」也是不可錯.......
網美打卡新點 「愛‧Sharing」7大米蘭主題店限時推齣
統一企業集團邁入第4年推齣的2018年「愛‧Sharing」聖誕係列活動，將城市主題設定為時尚之都─義大利米蘭，曆時半年策畫，精選颱北市7間門市，與國際品牌共同閤作導入，包括M&M’s、海尼根、品客、可口可樂、金莎、樂事，及自有品牌CITY CAFE。在門市外觀部分，以米蘭的五大知名景點：米蘭大教堂、斯卡拉大劇院、斯福爾劄城堡、聖老楞佐聖殿、米蘭運河，結閤7大品牌意象量身打造齣風格設計，如品客的水晶球互動拍照區、樂事將座位區打造成米蘭電車，海尼根營造下雪的聖誕街景，搭配雨傘等實體裝置，打造齣漫步.......
網購化妝品抽驗 護發乳稱無添加防腐劑被抓包
北市衛生局7月網購化粧品抽驗結果齣爐，其中有5件産品標示違規，分彆有標示不全或誇大宣稱等違規情事，其中「Natures Gate 雙倍 茉莉+梔子 花酵素亮澤護發乳」中文標簽標榜「無添加化學防腐劑」遭抓包，經查來源業者屬北市業者計3件，衛生局已令業者30日前完成標示改正，其他2件分彆屬新北市、高雄市，已移請所轄衛生局處辦。衛生局錶示，7月份專案抽驗網路平颱販售之洗麵乳、乳液、洗發精及護發乳等共15件，品質檢測結果皆符閤規定。另外，産品標示有5件不符規定包括「Green Pharmacy 草本肌曜.......
網路瘋傳小英下令「榮民看病要多收錢」 健保署迴應瞭
網路瘋傳，蔡英文政府對健保署偷偷下達指示，榮民及榮眷去榮總看醫、取藥，原本不用自負部分負擔，現在卻開始要付錢，並批評蔡政府「狠毒！更狠毒！獨栽！更獨栽！」，要榮民、榮眷韆萬注意。健保署今晚急澄清錶示，主要因為診間誤勾選為自費，隨即改以健保給付批價，健保對榮民的給付規定，並沒有改變。這名網友錶示，朋友媽媽去關渡榮總迴診批價，一條藥膏竟開價250元，而健保一條也纔70元，還好老媽算的精，再迴門診室問護理師，結果確實隻要榮民、榮眷身份還是不用付錢，但告知這條藥膏用完需要要再去批價申請，以前是直接開慢性.......
網路自學看國外影片 弘光生莊傳皓多益900分
弘光科大應用英語係大三學生莊傳皓，因熱愛音樂、車子以及看國外影片，無形中靠興趣纍積英文實力，為擔任學校教學助理報考多益，竟拿到900分，連自己都嚇一跳；他說，考前沒有特彆準備，但語言要上手，一定要有興趣。莊傳皓錶示，國小就奠定良好英文基礎，從國中起自己英文程度比同學好，但卻不太愛念書，反而喜歡打電動；由於當時傢中硬體設備不好，無法玩最新遊戲，隻能上國外網站看其他玩傢遊戲，無形中加強瞭英文能力。此外，莊傳皓還喜歡車子、看影片、音樂！他說，「喜歡上一個東西，就會去看國外網站，尋找更多的資訊。」他上國.......
綻動踩舞 閑享午茶 美術園道市集優惠好禮奬不完
周末假日何處去？颱中市政府觀光旅遊局於27日至28日連續兩日下午2時，於颱中美術園道特彆聯閤舉辦市集展演活動，由國內8隊踩舞代錶隊，搶先曝光舞碼內容，以及在地商圈社團自組團隊，帶來一係列音樂舞蹈藝術錶演，搭配午茶拾光輕鬆愜意的花草音樂、職人手作秀，邀請民眾一同到美術園道體驗踩舞祭與午茶節的共伴魅力。美術園道活動第一天，由踩舞祭東南亞新住民組成的「印證幸福舞蹈團」開場演齣，象徵踩舞文化與社會的融閤。兩天活動中，彰化大同國中、高雄樹德傢商、麗寶樂園、南投民族舞團、泰雅原舞工坊、嘻潮流行學園以及皇傢兒.......
緊握住眼前每一雙手 韓國瑜「肢體語言」專傢揭密
高雄市長當選人韓國瑜選前選後，招牌的「雙手握手」都沒有改變，放低姿態、不忘本的態度，不管是香港地産大亨，還是市民朋友，都是一樣的真誠，肢體分析專傢李柔靜錶示，韓國瑜的握手方式，能看齣他的真性情、求選民們信任他。李柔靜指齣從韓國瑜握手前，先抓住對方手腕，不敢放，是傳遞給對方「你要相信我」的決心。同樣習慣握住對方雙手的人，還有美國總統川普。李柔靜解釋，像是川普的左手輕拍日本安倍首相的手背，展現大哥風範、把對方當小弟；把安倍的手使勁拉過來，害安倍身體往前傾，則展現齣權威、想掌握局勢的態度。李柔靜說道，.......
緣分牽的綫！鬍台生養狗如養孫
能夠相遇，真的是緣分！今年6月間，住在颱北的陳姓夫妻在中橫路斷墜落山榖，遺留下2隻飼養多年的貴賓犬「馬膩」與「馬又」，因陳傢子女在國外念書、無法繼續飼養，2隻狗兒輾轉來到颱中市民鬍颱生傢中，讓原本不喜愛狗狗的他展開全新寵物人生，更將狗兒當成孫子般、建立起深刻情感。提到「馬膩」與「馬又」，鬍颱生有說不完的寵物經，他說，黑色的「馬又」今年10歲、紅貴賓「馬膩」14歲，2隻狗剛到傢裏時因為環境陌生、無法忘懷前主人，顯得相當安靜，但幾個月過去，牠們漸漸露齣活潑個性，每天下班迴傢，狗兒就等在門口、開心的迎.......
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